支店に税務調査が入ることはある？

ある企業の支店で経理をしております。 このたび当社に税務調査が入り、東京にある本社に国税局の方が来られているそうです。私のいる支店は大阪にありますが、当支店にも税務調査の対象として調査されることはあるのでしょうか？ 支店では、基本的に支店の収支に関する通帳と現金出納帳の管理くらいで、帳簿等の作成など主要な事は本社で全てしております。

支店も会社の一部ですから、当然税務調査の対象であり、実際に支店に対する税務調査は普通に行われています。ただ、支店だけに税務調査が入ることはありえません。反面調査ならあり得ますが。

一般的な税務調査においては、通常は本店で調査をして、必要に応じて支店を調べることとなります。
税務署の行う特別調査、総合調査や、国税局の資料調査課により行われる調査は、事前通知なしに本店・支店両方に同時に調査に入ることもあります。また、国税局の査察部による強制調査は、本店、支店、関係会社、社長の自宅、愛人宅、銀行などを同時に調査着手します。