会社への立替金の請求に個人的な費用が入っていたら

今度、税務署調査が会社に入ります。 小さい会社なので、会社の経費を社員が立替払いをすることがよくあります。社員は自分のカードで支払いをし、月末にカード会社から請求明細が来て、その請求書をもとに会社に立替分を請求をします。私的に使用した分の請求も含まれているので、その分は消して請求していますが、一部消し忘れがある可能性があります。 もし消し忘れがあり、調査官にそれを指摘されたらどいしたら良いのでしょうか？ 後から、会社に返金すれば問題はないのでしょうか？

普段から正しい帳簿付けを心がけていれば、税務調査が来ても何も心配いりません。

人間のすることですから、会計処理に勘違いや誤記入があるものです。これは仕方ないことですし税務署もそれをよく知っています。そうした間違いを税務署は指摘し、訂正するように言ってくるのです。もしそうした指導があったら、良く調べて反論が有れば言うべきですが、たいていは向こうはプロですから、その指摘に反論することは困難でしょう。

会社に結果的に私費を請求してしまい、それが会社の経費になっていた場合も同じことです。

税務署は淡々とこれは経費になりませんねという指摘をするだけです。

むしろ会社側に怒られるかもしれませんね・・・（笑）